Analiza atrofii mózgu na podstawie segmentacji

Rysunek: Korelacja pomiędzy wiekiem a prawą dolną komorą boczną

W ramach zadania przeprowadzono segmentację struktur mózgu na obrazach T1-ważonych za pomocą modelu SynthSeg. Wyniki segmentacji, obejmujące objętości wybranych struktur mózgu, zostały zestawione w formacie tabelarycznym. Część analizowanych wyników przedstawiono poniżej. W pierwszym kroku sprawdzono jak objętość poszczególnych struktur koreluje z wiekiem.

W następnym kroku policzono korelacje objętości poszczególnych struktur z parametrami klinicznymi, reprezentowanymi przez wybrane wyniki testów klinicznych. Korelacja została policzona przy użyciu funkcji z biblioteki pandas, z wykorzystaniem korelacji Pearsona. Analiza obejmowała zestawienie wyników korelacji dla wszystkich struktur i wszystkich testów klinicznych w jednej tabeli, umożliwiającej ocenę wzajemnych zależności. Częściowo tabela została przedstawiona poniżej.

Parametry kliniczne uwzględnione w analizie to:

  • TEST9: test 9 kołków.
  • TEST25: test 25 kroków.
  • SDMT_WYNIK: wynik testu Symbol Digit Modalities Test, oceniającego funkcje poznawcze.
  • BECK_WYNIK: wynik skali depresji Becka, oceniającej nasilenie objawów depresyjnych.
  • FSMC_WYNIK: ogólny wynik skali FSMC (Fatigue Scale for Motor and Cognitive Functions).
  • PODSK_POZN: podskala FSMC dotycząca funkcji poznawczych.
  • PODSK_RUCH: podskala FSMC dotycząca funkcji ruchowych.
  • MSIS29_WYNIK: wynik skali MSIS-29 (Multiple Sclerosis Impact Scale), oceniającej wpływ stwardnienia rozsianego na jakość życia pacjenta.
 TEST9 RAZEM CZASTEST25 STOP_ITEST25 STOP_IITEST25 WYNIK SREDNISDMT WYNIK
Left Cerebral White Matter-0,065-0,104-0,100-0,1020,259
Left Cerebral Cortex-0,053-0,136-0,137-0,1370,227
Left Lateral Ventricle0,176-0,054-0,073-0,064-0,349
Left Inferior Lateral Ventricle0,036-0,007-0,013-0,010-0,131
Left Cerebellum White Matter-0,123-0,006-0,003-0,0050,265
Left Cerebellum Cortex-0,0760,0340,0290,0320,265
Left Thalamus-0,189-0,020-0,012-0,0160,378
Left Caudate-0,2190,0140,0130,0130,469
Left Putamen-0,241-0,085-0,085-0,0860,407
Left Pallidum-0,250-0,087-0,082-0,0850,386
3rd Ventricle0,2120,0880,0640,077-0,263
4th Ventricle-0,0040,0280,0440,0360,018
Brain-Stem-0,0280,003-0,006-0,0020,132
Left Hippocampus-0,124-0,056-0,039-0,0480,246
Left Amygdala-0,088-0,093-0,092-0,0930,265
CSF0,0540,0080,0030,005-0,071

Rysunek: Wizualizacja zmiany objętości w poszczególnych regionach zainteresowania.

Wizualizacja

Newsletter

Zapisz się do naszego newslettera aby otrzymywać informacje o aktualnościach, nowych projektach badawczych czy publikacjach.