CIRCULATE

Projekt badawczy CIRCULATE

W latach 2015–2018 zrealizowano projekt badawczy o akronimie CIRCULATE na podstawie umowy z Narodowym Centrum Badań i Rozwoju nr STRATEGMED2/265761/10/NCBR/2015, w ramach programu STRATEGMED. Celem projektu była regeneracja uszkodzeń niedokrwiennych układu sercowo-naczyniowego z wykorzystaniem galarety Whartona jako nieograniczonego źródła terapeutycznych komórek macierzystych (WJMSC).

Projekt zrealizowano w konsorcjum złożonym z sześciu jednostek: Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego, Krakowskiego Szpitala Specjalistycznego im. Jana Pawła II, Polskiego Banku Komórek Macierzystych SA, Jagiellońskiego Centrum Innowacji sp. z o.o., Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie oraz Śląskiego Uniwersytetu Medycznego w Katowicach.

CIRCULATE | NMR Lab

Innowacyjne techniki BSD-DTI i sBSD-DTI

Tematem zadań realizowanych przez AGH był rozwój metod obrazowania wykorzystujących zjawisko magnetycznego rezonansu jądrowego (MRJ) do ilościowej oceny potencjału regeneracyjnego WJMSC w modelach uszkodzeń mięśnia sercowego i mięśni szkieletowych. Opracowano innowacyjne techniki obrazowania współczynników i tensora dyfuzji (DWI, DTI) z zastosowaniem metod BSD-DTI i sBSD-DTI, chronionych patentami międzynarodowymi. Wdrożono te metody na klinicznych skanerach MRI oraz opracowano komplementarne protokoły badań MRJ, umożliwiające ich wykorzystanie w praktyce klinicznej.

W ramach projektu przeprowadzono również parametryzację komórek WJMSC in vitro z zastosowaniem metod MRJ, o potencjale przełożenia na badania in vivo. Uzyskane wyniki stanowią podstawę do dalszych prac nad wdrożeniem nieinwazyjnego obrazowania terapii komórkowej w kardiologii regeneracyjnej.

 

Publikacje

Publikacje 2022

Diffusion tensor magnetic resonance imaging of the human heart in health and in acute myocardial infarction using diffusion weighted echo planar imaging technique with spin echo signals

Autorzy: Mazur W, Urbańczyk-Zawadzka M, Czyż Ł, Kwiecień E, Banyś R, Musiałek P, Krzyżak A. Źródło: Advances in Interventional Cardiology
Zobacz więcej...
Publikacje 2022

Diffusion tensor imaging as a tool to assess the structure of lower limb muscles invisible on T1 and T2 weighted images in the course of the chronic phase of peripheral artery disease

Autorzy: Mazur W, Urbańczyk-Zawadzka M, Banyś R, Obuchowicz R, Trystuła M, Krzyżak AT. Źródło: Advances in Interventional Cardiology
Zobacz więcej...
Publikacje 2022

Low-field 1H NMR parameterization of model cell suspensions. A diffusion and relaxation study

Autorzy: Habina-Skrzyniarz I, Krzyżak AT. Źródło: Advances in Interventional Cardiology
Zobacz więcej...
Publikacje 2022

Prospects and Challenges for the Spatial Quantification of the Diffusion of Fluids Containing 1H in the Pore System of Rock Cores

Autorzy: Krzyżak AT, Mazur W, Fheed A, Węglarz W. Źródło: Journal of Geophysical Research: Solid Earth
Zobacz więcej...
Publikacje 2022

Nuclear magnetic resonance footprint of Wharton Jelly mesenchymal stem cells death mechanisms and distinctive in-cell biophysical properties in vitro

Autorzy: Krzyżak AT, Habina-Skrzyniarz I, Mazur W, Sułkowski M, Kot M, Majka M. Źródło: Journal of Cellular and Molecular Medicine
Zobacz więcej...
Publikacje 2022

Diffusion-weighted imaging and diffusion tensor imaging of the heart in vivo: major developments

Autorzy: Mazur W, Krzyżak AT, Hennel F. Źródło: Advances in Interventional Cardiology
Zobacz więcej...
Publikacje 2021

Enhanced Resolution Analysis for Water Molecules in MCM-41 and SBA-15 in Low-Field T₂ Relaxometric Spectra

Autorzy: Stoch G, Krzyżak AT. Źródło: Molecules
Zobacz więcej...
Publikacje 2021

Diffusion as a Natural Contrast in MR Imaging of Peripheral Artery Disease (PAD) Tissue Changes. A Case Study of the Clinical Application of DTI for a Patient with Chronic Calf Muscles Ischemia

Autorzy: Mazur W, Urbańczyk-Zawadzka M, Banyś R, Obuchowicz R, Trystuła M, Krzyżak AT. Źródło: Diagnostics
Zobacz więcej...
Publikacje 2021

Screening Metal–Organic Frameworks for Separation of Binary Solvent Mixtures by Compact NMR Relaxometry

Autorzy: Wagemann M, Radzik N, Krzyżak A, Adams A. Źródło: Molecules
Zobacz więcej...
Publikacje 2021

NMR relaxometry interpretation of source rock liquid saturation — A holistic approach

Autorzy: Aliya Mukhametdinova, Iwona Habina-Skrzyniarz, Andrey Kazak, Artur Krzyżak. Źródło: Marine and Petroleum Geology
Zobacz więcej...
Publikacje 2020

Attempts at the Characterization of In-Cell Biophysical Processes Non-Invasively—Quantitative NMR Diffusometry of a Model Cellular System

Autorzy: Mazur W, Krzyżak AT. Źródło: Cells
Zobacz więcej...
Publikacje 2020

Water Interactions in Hybrid Polyacrylate-Silicate Hydrogel Systems

Autorzy: Mastalska-Popławska J, Stempkowska A, Habina-Skrzyniarz I, Krzyżak AT Źródło: Materials
Zobacz więcej...
Publikacje 2020

Identification of Proton Populations in Cherts as Natural Analogues of Pure Silica Materials by Means of Low Field NMR

Autorzy: Krzyżak A, Mazur W, Matyszkiewicz J, Kochman A. Źródło: Journal of Physical Chemistry C
Zobacz więcej...
Publikacje 2020

Overcoming the barriers to the exploration of nanoporous shales porosity

Autorzy: Krzyżak AT, Habina-Skrzyniarz I, Machowski G, Mazur W. Źródło: Microporous and Mesoporous Materials
Zobacz więcej...
Publikacje 2019

Synthesis and characterization of cross-linked poly(sodium acrylate)/sodium silicate hydrogels

Autorzy: Mastalska-Popławska J, Izak P, Wójcik Ł, Stempkowska A, Góral ZL, Krzyżak AT, Habina I. Źródło: Polymer Engineering and Science
Zobacz więcej...
Publikacje 2019

Assessment of the systematic errors caused by diffusion gradient inhomogeneity in DTI – computer simulations

Autorzy: Borkowski K, Krzyżak AT. Źródło: NMR in Biomedicine
Zobacz więcej...
Publikacje 2018

Analysis and correction of errors in DTI-based tractography due to diffusion gradient inhomogeneity

Autorzy: Borkowski K, Krzyżak AT. Źródło: Journal of Magnetic Resonance
Zobacz więcej...
Publikacje 2018

The Generalized Stejskal-Tanner Equation for non-uniform magnetic field gradients

Autorzy: Borkowski K, Krzyżak AT Źródło: Journal of Magnetic Resonance
Zobacz więcej...
Publikacje 2016

Low field ^1H NMR characterization of mesoporous silica MCM-41 and SBA-15 filled with different amounts of water

Autorzy: Krzyżak AT, Habina I Źródło: Microporous and Mesoporous Materials
Zobacz więcej...

Zagadnienia badawcze

Główne szlaki dyfuzji (PDT) w obrazowaniu rdzeni skalnych z wykorzystaniem DTI

Parametry tensora dyfuzji (DTI) do oceny anizotropii systemu porowego

Trójwymiarowe mapy 3D śladu macierzy b(r) w izocentrum magnesu dla klinicznego skanera 3T

Wpływ niejednorodności gradientów na deformację spektrum tensora dyfuzji i anizotropii frakcyjnej – walidacja metody BSD-DTI

Relaksometria NMR w niskim polu jako narzędzie do ilościowej charakterystyki oddziaływań woda–powierzchnia w mezoporowatej krzemionce MCM-41 i SBA-15

Parametryzacja układów ilastych i kerogenu metodą niskopolowego NMR: mapy T₁–T₂, frakcje wody i porowatość

Rozbieżności w orientacji włókien w DTI wskutek niejednorodności gradientów: teoria, symulacje i walidacja kliniczna

Rozróżnienie populacji protonowych i identyfikacja inkluzji w naturalnych krzemionkach za pomocą 1H LF-NMR: zaawansowana analiza porowatości i potencjał w badaniach układów biologicznych

Rozszerzone możliwości LF-NMR: różnicowa analiza porowatości i predykcja TOC w materiałach łupkowych

Nieinwazyjna parametryzacja i nowa ścieżka do identyfikacji oraz śledzenia komórek macierzystych WJMSC in vitro i in vivo przy użyciu relaksometrii i dyfuzometrii LF-NMR

Wpływ korekcji BSD-DTI i parametrów rekonstrukcji na jakość traktografii w obszarach o złożonej topologii mózgu

Obrazowanie dyfuzji i tensora dyfuzji serca: postępy technologiczne i wyzwania kliniczne

Zastosowanie sekwencji SE-EPI DTI w obrazowaniu ostrego zawału mięśnia sercowego — wstępne wyniki badania klinicznego

Ocena efektów terapii komórkami macierzystymi u pacjentki z krytycznym niedokrwieniem kończyny dolnej metodą MRI i BSD-DTI

Zastosowanie obrazowania tensora dyfuzji z korekcją BSD (BSD-DTI) w ocenie mięśni łydki u pacjenta z chorobą tętnic obwodowych (PAD) – studium przypadku z randomizowanego badania klinicznego

Newsletter

Zapisz się do naszego newslettera aby otrzymywać informacje o aktualnościach, nowych projektach badawczych czy publikacjach.